Sirvió junto con el de la Punta para proteger la entrada de la bahía. El faro interior data de 1845. Para proteger la entrada a la bahía se tendió, en 1630, entre el Morro y la Punta una cadena de cobre que obstaculizaba el paso de los barcos. Fue duramente defendido en el verano de 1762 cuando los ingleses tomaron la ciudad y asediaron el Morro durante 44 días